Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ptchd1Q14B62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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ptchd1Q14B62 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ptchd1Q14B62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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ptchd1Q14B62 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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ptchd1Q14B62 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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ptchd1Q14B62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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ptchd1Q14B62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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ptchd1Q14B62 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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ptchd1Q14B62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ptchd1Q14B62 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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