Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MitfQ08874 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MitfQ08874 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MitfQ08874 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MitfQ08874 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MitfQ08874 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MitfQ08874 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MitfQ08874 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MitfQ08874 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MitfQ08874 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MitfQ08874 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MitfQ08874 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms