Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MestQ07646 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MestQ07646 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MestQ07646 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MestQ07646 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MestQ07646 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MestQ07646 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MestQ07646 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MestQ07646 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MestQ07646 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MestQ07646 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MestQ07646 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MestQ07646 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MestQ07646 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MestQ07646 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MestQ07646 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MestQ07646 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MestQ07646 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MestQ07646 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MestQ07646 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MestQ07646 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MestQ07646 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MestQ07646 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MestQ07646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MestQ07646 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MestQ07646 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MestQ07646 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MestQ07646 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MestQ07646 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MestQ07646 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MestQ07646 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MestQ07646 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MestQ07646 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MestQ07646 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MestQ07646 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MestQ07646 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MestQ07646 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MestQ07646 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MestQ07646 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MestQ07646 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MestQ07646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MestQ07646 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MestQ07646 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MestQ07646 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MestQ07646 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MestQ07646 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MestQ07646 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MestQ07646 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MestQ07646 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MestQ07646 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MestQ07646 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MestQ07646 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MestQ07646 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MestQ07646 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MestQ07646 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MestQ07646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MestQ07646 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MestQ07646 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MestQ07646 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MestQ07646 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MestQ07646 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MestQ07646 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MestQ07646 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MestQ07646 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MestQ07646 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MestQ07646 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MestQ07646 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MestQ07646 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MestQ07646 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MestQ07646 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MestQ07646 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MestQ07646 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MestQ07646 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms