Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col9a2Q07643 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col9a2Q07643 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col9a2Q07643 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col9a2Q07643 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms