Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Col17a1Q07563 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Col17a1Q07563 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Col17a1Q07563 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Col17a1Q07563 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Col17a1Q07563 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Col17a1Q07563 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col17a1Q07563 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms