Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabpb1Q00420 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabpb1Q00420 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabpb1Q00420 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabpb1Q00420 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb1Q00420 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms