Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps45P97390 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps45P97390 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps45P97390 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps45P97390 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps45P97390 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps45P97390 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps45P97390 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps45P97390 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps45P97390 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps45P97390 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms