Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atp1b3P97370 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1b3P97370 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp1b3P97370 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atp1b3P97370 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b3P97370 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b3P97370 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms