Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis3P97368 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis3P97368 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Meis3P97368 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Meis3P97368 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis3P97368 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis3P97368 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis3P97368 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Meis3P97368 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Meis3P97368 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis3P97368 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis3P97368 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms