Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh8P97291 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh8P97291 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh8P97291 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms