Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpcaP84075 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpcaP84075 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpcaP84075 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpcaP84075 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HpcaP84075 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HpcaP84075 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpcaP84075 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HpcaP84075 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HpcaP84075 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HpcaP84075 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpcaP84075 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpcaP84075 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpcaP84075 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpcaP84075 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpcaP84075 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpcaP84075 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HpcaP84075 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpcaP84075 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpcaP84075 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpcaP84075 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpcaP84075 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms