Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plxna1P70206 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plxna1P70206 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxna1P70206 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxna1P70206 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxna1P70206 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms