Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sumo1P63166 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sumo1P63166 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sumo1P63166 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms