Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtnP63089 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtnP63089 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtnP63089 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtnP63089 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtnP63089 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtnP63089 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtnP63089 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtnP63089 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtnP63089 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtnP63089 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtnP63089 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtnP63089 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtnP63089 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtnP63089 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtnP63089 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtnP63089 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtnP63089 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtnP63089 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtnP63089 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtnP63089 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtnP63089 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtnP63089 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtnP63089 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtnP63089 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtnP63089 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtnP63089 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtnP63089 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtnP63089 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtnP63089 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtnP63089 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtnP63089 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtnP63089 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtnP63089 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtnP63089 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtnP63089 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms