Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PlnP61014 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PlnP61014 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PlnP61014 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PlnP61014 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PlnP61014 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PlnP61014 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PlnP61014 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PlnP61014 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PlnP61014 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PlnP61014 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PlnP61014 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PlnP61014 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PlnP61014 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PlnP61014 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PlnP61014 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PlnP61014 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PlnP61014 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PlnP61014 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PlnP61014 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PlnP61014 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PlnP61014 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PlnP61014 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PlnP61014 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PlnP61014 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PlnP61014 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PlnP61014 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PlnP61014 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PlnP61014 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PlnP61014 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PlnP61014 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PlnP61014 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PlnP61014 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PlnP61014 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PlnP61014 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PlnP61014 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms