Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sem1P60897 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sem1P60897 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sem1P60897 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sem1P60897 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sem1P60897 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sem1P60897 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sem1P60897 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms