Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3b6P59708 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3b6P59708 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b6P59708 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sf3b6P59708 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms