Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcif1P59114 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcif1P59114 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcif1P59114 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcif1P59114 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcif1P59114 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms