Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tlr8P58682 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tlr8P58682 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tlr8P58682 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr8P58682 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tlr8P58682 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tlr8P58682 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms