Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Strn4P58404 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Strn4P58404 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Strn4P58404 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Strn4P58404 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Strn4P58404 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Strn4P58404 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Strn4P58404 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn4P58404 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Strn4P58404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Strn4P58404 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Strn4P58404 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Strn4P58404 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn4P58404 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Strn4P58404 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Strn4P58404 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Strn4P58404 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Strn4P58404 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms