Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp25P57080 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp25P57080 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp25P57080 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp25P57080 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp25P57080 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp25P57080 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp25P57080 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp25P57080 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp25P57080 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp25P57080 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp25P57080 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp25P57080 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp25P57080 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms