Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtskP55097 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CtskP55097 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtskP55097 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtskP55097 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtskP55097 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtskP55097 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtskP55097 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtskP55097 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtskP55097 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtskP55097 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtskP55097 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtskP55097 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtskP55097 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtskP55097 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtskP55097 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtskP55097 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtskP55097 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtskP55097 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtskP55097 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtskP55097 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtskP55097 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtskP55097 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtskP55097 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtskP55097 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtskP55097 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtskP55097 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtskP55097 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtskP55097 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtskP55097 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtskP55097 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtskP55097 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtskP55097 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtskP55097 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtskP55097 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtskP55097 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtskP55097 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtskP55097 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtskP55097 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtskP55097 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtskP55097 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtskP55097 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtskP55097 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtskP55097 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtskP55097 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtskP55097 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtskP55097 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtskP55097 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtskP55097 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtskP55097 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtskP55097 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtskP55097 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtskP55097 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtskP55097 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtskP55097 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtskP55097 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtskP55097 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtskP55097 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtskP55097 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtskP55097 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtskP55097 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtskP55097 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtskP55097 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtskP55097 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtskP55097 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtskP55097 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtskP55097 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtskP55097 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms