Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ThpoP40226 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ThpoP40226 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ThpoP40226 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ThpoP40226 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ThpoP40226 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ThpoP40226 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThpoP40226 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ThpoP40226 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ThpoP40226 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ThpoP40226 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ThpoP40226 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ThpoP40226 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ThpoP40226 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ThpoP40226 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ThpoP40226 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThpoP40226 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ThpoP40226 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThpoP40226 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ThpoP40226 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThpoP40226 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ThpoP40226 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ThpoP40226 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ThpoP40226 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms