Protein–RNA interactions for Protein: P36368

Egfbp2, Epidermal growth factor-binding protein type B, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egfbp2P36368 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Egfbp2P36368 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Egfbp2P36368 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Egfbp2P36368 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egfbp2P36368 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egfbp2P36368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms