Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox5P35710 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox5P35710 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox5P35710 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox5P35710 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox5P35710 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox5P35710 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sox5P35710 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox5P35710 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox5P35710 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms