Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Grin1P35438 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Grin1P35438 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Grin1P35438 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin1P35438 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin1P35438 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin1P35438 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin1P35438 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin1P35438 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin1P35438 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms