Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp4P35123 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp4P35123 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp4P35123 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp4P35123 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp4P35123 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp4P35123 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp4P35123 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp4P35123 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp4P35123 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp4P35123 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp4P35123 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp4P35123 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp4P35123 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp4P35123 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms