Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Msr1P30204 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Msr1P30204 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Msr1P30204 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Msr1P30204 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msr1P30204 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msr1P30204 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msr1P30204 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms