Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa4P28311 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa4P28311 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa4P28311 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa4P28311 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa4P28311 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms