Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa2P28309 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa2P28309 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa2P28309 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa2P28309 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa2P28309 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms