Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc6P23475 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc6P23475 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc6P23475 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xrcc6P23475 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms