Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PparaP23204 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PparaP23204 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PparaP23204 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PparaP23204 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PparaP23204 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PparaP23204 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PparaP23204 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PparaP23204 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PparaP23204 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PparaP23204 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PparaP23204 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PparaP23204 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PparaP23204 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PparaP23204 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PparaP23204 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PparaP23204 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PparaP23204 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PparaP23204 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PparaP23204 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PparaP23204 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PparaP23204 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PparaP23204 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PparaP23204 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PparaP23204 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PparaP23204 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PparaP23204 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PparaP23204 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PparaP23204 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PparaP23204 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PparaP23204 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PparaP23204 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PparaP23204 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PparaP23204 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PparaP23204 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PparaP23204 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PparaP23204 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PparaP23204 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PparaP23204 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PparaP23204 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PparaP23204 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PparaP23204 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PparaP23204 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PparaP23204 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PparaP23204 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PparaP23204 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PparaP23204 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PparaP23204 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PparaP23204 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PparaP23204 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PparaP23204 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PparaP23204 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PparaP23204 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PparaP23204 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PparaP23204 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PparaP23204 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PparaP23204 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PparaP23204 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PparaP23204 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PparaP23204 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PparaP23204 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PparaP23204 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PparaP23204 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PparaP23204 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PparaP23204 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PparaP23204 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PparaP23204 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PparaP23204 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PparaP23204 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PparaP23204 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PparaP23204 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PparaP23204 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PparaP23204 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PparaP23204 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PparaP23204 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PparaP23204 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PparaP23204 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PparaP23204 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PparaP23204 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PparaP23204 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PparaP23204 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PparaP23204 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PparaP23204 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PparaP23204 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms