Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phka1P18826 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phka1P18826 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phka1P18826 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phka1P18826 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Phka1P18826 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phka1P18826 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phka1P18826 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phka1P18826 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phka1P18826 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phka1P18826 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phka1P18826 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phka1P18826 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Phka1P18826 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phka1P18826 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Phka1P18826 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phka1P18826 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms