Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ass1P16460 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ass1P16460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ass1P16460 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ass1P16460 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ass1P16460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ass1P16460 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ass1P16460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms