Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fgf4P11403 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf4P11403 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf4P11403 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms