Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Becn2P0DM65 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Becn2P0DM65 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Becn2P0DM65 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms