Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd4P06332 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd4P06332 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd4P06332 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd4P06332 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd4P06332 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd4P06332 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd4P06332 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd4P06332 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd4P06332 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd4P06332 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd4P06332 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd4P06332 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd4P06332 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd4P06332 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd4P06332 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd4P06332 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms