Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04213 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04213 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04213 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04213 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P04213 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P04213 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04213 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04213 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04213 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P04213 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P04213 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P04213 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P04213 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P04213 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P04213 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P04213 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P04213 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P04213 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P04213 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04213 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04213 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P04213 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P04213 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P04213 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P04213 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P04213 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P04213 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04213 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04213 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04213 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04213 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04213 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04213 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04213 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04213 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04213 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P04213 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04213 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04213 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04213 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04213 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04213 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04213 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04213 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04213 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04213 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04213 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04213 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04213 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04213 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04213 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04213 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P04213 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04213 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P04213 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04213 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04213 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04213 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04213 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04213 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04213 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04213 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04213 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04213 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04213 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04213 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04213 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P04213 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P04213 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04213 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04213 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04213 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04213 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04213 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04213 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04213 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04213 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04213 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms