Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-Ab1P01921 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-Ab1P01921 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Ab1P01921 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms