Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01789 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01789 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01789 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01789 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01789 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01789 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01789 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01789 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01789 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01789 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01789 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01789 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01789 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01789 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01789 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01789 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01789 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01789 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
P01789 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
P01789 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01789 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01789 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01789 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01789 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01789 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01789 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01789 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01789 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01789 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01789 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01789 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01789 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01789 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01789 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01789 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01789 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01789 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01789 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01789 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01789 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01789 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01789 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01789 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01789 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01789 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01789 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01789 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01789 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01789 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01789 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01789 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms