Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01745 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01745 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01745 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01745 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01745 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01745 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01745 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01745 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01745 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01745 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01745 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01745 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01745 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01745 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01745 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01745 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01745 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01745 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01745 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01745 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01745 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01745 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01745 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01745 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01745 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01745 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01745 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01745 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01745 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01745 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01745 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01745 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01745 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01745 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01745 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01745 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01745 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01745 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01745 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01745 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01745 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01745 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01745 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01745 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01745 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01745 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01745 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01745 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms