Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01739 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01739 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01739 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01739 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01739 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01739 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01739 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01739 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01739 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01739 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01739 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01739 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01739 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01739 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01739 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01739 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01739 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01739 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01739 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01739 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01739 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01739 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01739 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01739 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01739 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01739 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01739 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01739 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01739 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01739 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01739 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01739 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01739 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01739 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01739 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01739 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01739 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01739 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01739 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01739 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01739 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01739 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01739 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms