Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01663 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01663 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01663 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01663 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01663 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01663 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01663 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01663 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01663 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01663 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01663 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01663 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01663 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01663 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01663 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01663 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01663 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01663 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01663 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01663 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01663 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01663 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01663 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01663 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01663 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01663 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01663 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01663 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01663 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01663 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01663 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01663 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01663 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01663 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01663 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01663 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01663 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
P01663 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01663 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01663 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01663 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01663 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01663 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P01663 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01663 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20■□□□□ 0.79
P01663 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01663 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01663 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01663 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01663 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01663 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
P01663 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01663 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01663 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01663 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01663 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01663 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01663 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01663 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01663 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01663 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01663 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01663 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01663 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01663 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms