Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4bP01029 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4bP01029 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4bP01029 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4bP01029 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C4bP01029 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4bP01029 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4bP01029 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4bP01029 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4bP01029 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4bP01029 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4bP01029 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C4bP01029 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4bP01029 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
C4bP01029 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
C4bP01029 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4bP01029 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C4bP01029 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
C4bP01029 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C4bP01029 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C4bP01029 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C4bP01029 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C4bP01029 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4bP01029 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C4bP01029 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4bP01029 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C4bP01029 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C4bP01029 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C4bP01029 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C4bP01029 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C4bP01029 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C4bP01029 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
C4bP01029 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
C4bP01029 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4bP01029 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4bP01029 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4bP01029 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C4bP01029 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C4bP01029 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C4bP01029 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C4bP01029 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C4bP01029 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C4bP01029 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C4bP01029 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C4bP01029 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C4bP01029 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C4bP01029 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4bP01029 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4bP01029 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4bP01029 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C4bP01029 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C4bP01029 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C4bP01029 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C4bP01029 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C4bP01029 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
C4bP01029 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C4bP01029 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C4bP01029 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C4bP01029 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C4bP01029 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C4bP01029 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C4bP01029 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C4bP01029 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
C4bP01029 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C4bP01029 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4bP01029 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
C4bP01029 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4bP01029 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4bP01029 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4bP01029 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4bP01029 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4bP01029 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4bP01029 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4bP01029 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4bP01029 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4bP01029 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4bP01029 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4bP01029 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4bP01029 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4bP01029 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4bP01029 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4bP01029 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4bP01029 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4bP01029 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4bP01029 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4bP01029 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4bP01029 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4bP01029 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4bP01029 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4bP01029 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4bP01029 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C4bP01029 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4bP01029 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4bP01029 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C4bP01029 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms