Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sypl2O89104 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sypl2O89104 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sypl2O89104 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sypl2O89104 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sypl2O89104 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sypl2O89104 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sypl2O89104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sypl2O89104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sypl2O89104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms