Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cops3O88543 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cops3O88543 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cops3O88543 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cops3O88543 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cops3O88543 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cops3O88543 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cops3O88543 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops3O88543 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms