Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh16O88338 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh16O88338 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh16O88338 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh16O88338 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms