Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srpk1O70551 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srpk1O70551 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srpk1O70551 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srpk1O70551 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms