Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt5hO55201 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Supt5hO55201 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Supt5hO55201 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Supt5hO55201 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Supt5hO55201 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms