Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syngr1O55100 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syngr1O55100 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syngr1O55100 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syngr1O55100 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms